1. 增值税计税方式： 一般纳税人如采用一般计税，可以抵扣进项税额。其应纳税额由当期销项税额减去当期进项税额得出。而小规模纳税人则无法进行进项抵扣，其应纳税额等于销售额乘以征收率。
2. 适用增值税税率或征收率： 对于一般纳税人，他们需按照适用的增值税税率缴纳税款，目前有四档税率分别为13%、9%、6%和0%。简易计税则采用5%和3%的征收率。而小规模纳税人则需按3%和5%的征收率缴纳税款。
3. 申报方面的不同： 一般纳税人通常每月需要申报一次税款，而小规模纳税人多数是每季度申报，但也可以选择每月申报。值得注意的是，他们所使用的增值税申报表也有所不同。
4. 税收优惠的不同： 例如，小规模纳税人在月销售额未超过15万（季度未超过45万）的情况下，可免征增值税。此外，城建税及教育费附加等六税两费可以在50%税额幅度内减征。然而，这些优惠政策并不适用于一般纳税人。
自2020年3月1日至12月31日，湖北省的增值税小规模纳税人在适用3%征收率的应税销售收入时，可以免征增值税。从2021年1月1日至3月31日，该政策继续实施；而从2021年4月1日至12月31日，湖北省的增值税小规模纳税人在适用3%征收率的应税销售收入时，将减按1%征收率征收增值税。
自2020年3月1日至2021年12月31日，除湖北省外的其他省、自治区、直辖市的增值税小规模纳税人在适用3%征收率的应税销售收入时，也将减按1%征收率征收增值税。