企业针对员工缺勤扣款工资的会计处理，可以计入“营业外收入”科目核算，具体如下：

1、扣款时会计分录：

借：其他应收款，

贷：营业外收入。

2、发工资扣除时会计分录：

借：应付职工薪酬，

贷：其他应收款。