单位将自有车辆卖出会计分录如下：

1、出售时转入清理时，会计分录：

借：固定资产清理，

借：累计折旧，

借：固定资产减值准备，

贷：固定资产 (固定资产的账面原价)。

2、计算交纳税金时，缴纳增值税，会计分录：

借：固定资产清理，

贷：应交税费—应交增值税（销项税额）。

3、收回出售固定资产的价款等时，会计分录：

借：银行存款，

贷：固定资产清理。

4、固定资产清理后的净收益，会计分录：

借：固定资产清理，

贷：营业外收入—处理固定资产净收益 。