公司支付给员工的慰问金，对于公司来说是作为福利的一部分入账，根据员工所在的部门计入管理费用/销售费用—福利费科目，该项福利费需要计入到工资所得，缴纳个人所得税，其分录为，

借：管理费用/销售费用—福利费，

贷：应付职工薪酬—货币性福利。

实际支付时，分录为，

借：应付职工薪酬—货币性福利，

贷：银行存款。