发票勾选认证操作流程：

登录增值税发票综合服务平台，点击“发票勾选”；

选择“未勾选”的选项和开票日期，点击“查询”；

所选的开票日期区间的所有未认证的发票均显示出来；

根据收到的纸质发票勾选所需认证的发票，点击“保存”后进行提交；

然后到发票勾选选择勾选统计，点击申请统计，大约五分钟后，刷新，然后确认签名，打印勾选汇总表就好了。