多个分店是否要分开核算，具体看单位管理的要求。

分店：主店之外下设的同类店，在经济上有附属关系，在管理上有一定的隶属关系，在品牌和产品上有授权关系。分店如果在不同的行政区域，还要办理分店的营业执照。