职工医药费应计入“职工福利费”科目，属于业务支出。其他支出科目，如其他福利费、住房公积金、职工失业保险、职工生育保险、职工年金、社会保险责任支出、商业保险费均记入职工福利费科目。
职工医药费的记账规则如下：医疗费用的发生，可在备用金账户中先从各部门预算支出中支付。实际费用支付凭据按月上报财务部门。财务部门针对上报的费用项目和支出金额，在现金支出科目下“职工福利费”进行登记。经核销后，把“职工福利费”科目的余额支出到备用金账户。
拓展知识：职工医药费是指公司为职工支付的相关医疗保健费用。这类费用是对企业职工的一种福利。职工医药费费用是由企业支出的。根据企业的支出情况，可以分为以下三类：一是人身意外保险；二是专项的职工医疗保险；三是企业报销的职工医疗费用。