区别不是很大，主要是缴费上，事业机关的基本养老险相对来说，个人担负的较少，对工龄也要算的，虽然之前不一定是缴了钱的，保障上由于视同缴费年数较长，所以领取的相对较多。不过随着国家要建立统一的养老保险，所以2者最终会走在一起。
企业保险为使企业永续经营或留住人才而设计之保险制度，其主要为寿险或健康险。企业保险对企业所提供的保障，主为避免对抗因企业所属主要部门或专门技术人员因身故或离职无法执行任务以致造成的企业损失，并为稳固企业的财务基础，以建立良好信誉关系。根据《事业单位人事管理条例》规定，事业单位及其工作人员依法参加社会保险，工作人员依法享受社会保险待遇。事业单位保险有养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。
企业保险的种类主要有：

1、财产保险：对国内企事业单位和机关、团体具有保险利益的财产进行承保的保险。
2、责任保险：以被保人的民事赔偿责任为保险标的的财产保险。
3、国内货物运输保险：以运输货物为保险标的，保险公司承担赔偿运输过程中自然灾害和意外事故造成损失的一种保险。
4、运输工具保险：以载人、载物或从事某种特殊作业的运输工具为保险标的的保险合同。
5、工程保险：承保在建工程和安装工程同一切不可预料的意外事故或安装不善所造成的损失费用和责任的保险。
6、保证保险：通过与投保人订立合同，向债权人担保，债务人按约履行债务，想投报单位保证雇员会履行职责，这两项担保内容称为保证保险。