在计算个人所得税时，可以扣除个人负担的社保金额。个人所得税的应纳税额可以通过以下公式进行计算：
个人所得税的应纳税额 = （工资 - 个人负担的五险一金 - 5000 - 专项扣除）*税率 - 速算扣除数
通过这个计算公式可知，在计算个人所得税的时候，是可以扣除个人负担的社保金额的。这意味着，在计算个人所得税时，个人所缴纳的社保费用可以作为一项可扣除的费用。
首先，需要了解的是，个人所得税的应纳税额是由多个因素决定的。其中，工资是一个重要的变量，它代表了个人的收入水平。然而，个人收入并非全部都需要纳税，因此需要减去一些特定的费用来计算出应纳税额。
其次，个人负担的五险一金也是需要考虑的因素之一。五险一金是指养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险和住房公积金。这些费用是由个人和雇主共同缴纳的，但在计算个人所得税时，只考虑个人所负担的部分。因此，个人所缴纳的五险一金金额可以从工资中扣除。
此外，个人所得税的计算公式中还包括了5000元的免税额和专项扣除。5000元免税额是指每个月的基本生活费用，超过这个金额的部分才需要纳税。而专项扣除是指根据个人的实际情况，可以额外扣除的一些费用，例如子女教育、住房贷款利息等。这些费用也可以从工资中扣除，以减少应纳税额。
最后，通过将以上各项扣除后，再乘以相应的税率和速算扣除数，就可以得出个人所得税的应纳税额。需要注意的是，税率和速算扣除数是根据国家税法规定的，不同收入水平和扣除项目会有不同的税率和速算扣除数。
综上所述，个人所得税的计算过程中，个人负担的社保金额是可以扣除的。这一规定旨在减轻个人的税负，使个人所得税更加公平合理。因此，在进行个人所得税申报时，个人应当准确记录并申报自己负担的社保金额，以便正确计算个人所得税的应纳税额。