个人所得税手续费退还金额的核对，即退付手续费核对，是对企业代扣代缴个人所得税后，税务局按照代扣代缴税额的2%返还给企业的金额进行核对的过程。
在过去，企业财税人员需要提交申请表到税务局现场办理此项业务，且每年只能申请一次，即申请上年度个税手续费返还。然而，随着技术的发展，现在我们可以直接在自然人申报系统里进行核对。一旦确认无误，只需提交申请，系统便会自动启动退税流程，这大大方便了纳税人办理此项业务。
在此，我们还需要补充一点关于支付个人所得税的现金流量选择的知识。支付的个人所得税的现金流量应列入“支付给职工以及为职工支付的现金”项目。这是因为，虽然企业代扣代缴个税实质上是为职工支付的工资的组成部分，但它并不是企业负担的税费。因此，企业代扣代缴个税现金流应被列入“支付给职工以及为职工支付的现金”项目。
至于现金流量表中的“支付的各项税费”项目，填列的税费必须由企业来承担。然而，代扣职工的个人所得税并非由企业承担，因此，这部分现金流不应被列入“支付的各项税费”项目。