既有工资薪酬又有经营所得的情况下，两者是互不影响的，可以分别进行申报。然而，需要注意的是扣除基数的六万元只能在其中一项中进行扣除。具体依据是《国家税务总局关于办理2021年度个人所得税综合所得汇算清缴事项的公告》（国家税务总局公告2022年第1号）。
同时取得综合所得和经营所得的纳税人，可以在综合所得或经营所得中申报减除费用6万元、专项扣除、专项附加扣除以及依法确定的其他扣除，但不得重复申报减除。
根据《中华人民共和国个人所得税法》第二条规定，下列各项个人所得应当缴纳个人所得税：
1. 工资、薪金所得； 2. 劳务报酬所得； 3. 稿酬所得； 4. 特许权使用费所得； 5. 经营所得； 6. 利息、股息、红利所得； 7. 财产租赁所得； 8. 财产转让所得； 9. 偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。