员工培训费的专用发票可以进行抵扣进项税。根据《增值税暂行条例》第十条，有五类项目的进项税额不得从销项税额中抵扣。这些项目包括：用于非增值税应税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物或者应税劳务；非正常损失的购进货物及相关的应税劳务；非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物或者应税劳务；国务院财政、税务主管部门规定的纳税人自用消费品；以及本条第（一）项至第（四）项规定的货物的运输费用和销售免税货物的运输费用。
然而，培训费用并不属于以上不得抵扣的项目之一。因此，员工培训费的专用发票是可以进行抵扣进项税的。需要注意的是，如果发生需要转出进项税额的情况，相关财务处理分录如下：当发生需要转出时，借记库存商品（在建工程、原材料、销售费用），贷记应交税费—应交增值税（进项税转出）。月底进行结转时，借记应交税费—应交增值税（进项税转出），贷记应交税费—未交增值税。