工程罚款应计入营业外支出科目进行核算。
营业外支出是指企业在生产经营期间，固定资产清理所发生的损失。借记“营业外支出”科目，贷记“固定资产清理”科目。企业在清查财产过程中，查明固定资产盘亏，借记“营业外支出”科目，贷记“待处理财产损益—待处理固定资产损溢”科目。
具体来说，当企业因违规行为或意外事件而收到工程罚款时，这笔款项应该被归类为营业外支出。这是因为工程罚款与企业的正常经营活动无关，而是由于特定情况而产生的额外费用。为了准确地记录和核算这笔费用，企业需要将工程罚款计入营业外支出科目。
在会计分录中，借方应记录营业外支出科目，表示企业发生了一笔额外的费用。贷方则应记录银行存款科目，表示企业的银行存款减少了相应的金额。通过这样的会计分录，企业可以清晰地了解工程罚款对其财务状况的影响。
综上所述，工程罚款应计入营业外支出科目进行核算。这样做有助于企业准确记录和分析工程罚款对其财务状况的影响，从而更好地管理和控制企业的财务风险。