当公司代垫款项时，会计处理上会将其计入其他应收款科目进行核算。其他应收款是指企业发生的除应收账款、应收票据和预付账款以外的其他各种应收、暂付的款项。
例如，当员工想要购买某个商品，暂时没有钱支付时，企业可以代垫该商品的费用。在这种情况下，会计分录如下：
借：其他应收款—XX员工 贷：银行存款等
通过这样的分录，企业将代垫的款项记入其他应收款科目，表示该笔款项是暂付款项，将来员工会偿还这笔费用。同时，企业也会在银行存款等科目中记录相应的减少。
其他应收款科目的存在可以帮助企业更好地管理与员工之间的代垫款项。通过及时记录和核算这些款项，企业可以掌握员工的欠款情况，并及时催收或进行后续处理。
总之，当公司代垫款项时，将其计入其他应收款科目进行核算是一种常见的会计处理方法。这样可以确保企业的财务状况得到准确反映，并帮助企业更好地管理与员工之间的代垫款项。