企业在支付商标注册费时，需要根据金额的大小来决定如何处理。如果金额较大，可以将其作为无形资产的一部分计入到无形资产—商标权中进行核算。然后按照无形资产的标准进行摊销。如果金额较小，可以直接计入当期费用进行处理。
对于计入无形资产的商标注册费，其会计分录为：借：无形资产—商标权；贷：银行存款等。这意味着企业将支付的商标注册费记入无形资产账户，同时减少银行存款。
在无形资产摊销时，会计分录为：借：销售费用—商标权；贷：累计摊销等。这意味着企业将摊销的金额记入销售费用账户，同时减少累计摊销账户。
总之，企业在处理商标注册费时，需要根据金额的大小来决定是计入无形资产还是计入当期费用。如果计入无形资产，需要按照无形资产的标准进行摊销。