《事业单位会计制度》是财政部于1997年制定的，旨在适应社会主义市场经济体制的需要。该制度是根据《事业单位会计准则》(试行)制定的，旨在进一步规范事业单位的会计核算，加强会计管理，促进社会各项事业的健康和有序发展。自1998年1月1日起，该制度开始执行，同时废止了财政部于1988年发布的《事业行政单位预算会计制度》。
为了进一步提高会计信息质量并规范事业单位的会计核算，财政部根据《中华人民共和国会计法》、《事业单位会计准则》和《事业单位财务规则》对《事业单位会计制度》(财预字﹝1997﹞288号)进行了修订。修订后的制度自2013年1月1日起生效，同时废止了1997年7月17日财政部印发的《事业单位会计制度》(财预字﹝1997﹞288号)。
通过制定和修订《事业单位会计制度》，财政部希望进一步规范事业单位的会计核算和管理，提高会计信息的质量。这将有助于促进社会各项事业的健康、有序发展，并为事业单位的财务管理提供更加科学和有效的依据。