当公司发行证券时，会收到代理承销证券款。这笔款项是证券公司在规定的期限内将发行人发行的证券销售出去，并按照约定收取的佣金或者约定的报酬。在账务处理上，当公司收到代理承销证券款时，需要进行以下操作：
首先，借方应记入银行存款科目，表示公司的银行存款增加。这是因为公司收到了一笔款项，所以银行存款账户应该相应地增加。
其次，贷方应记入代理承销证券款科目，表示公司需要支付给代理承销证券款。这是因为公司需要支付给代理承销证券款作为佣金或报酬，所以代理承销证券款科目应该相应地减少。
当公司需要将收到的代理承销证券款支付给对方时，也需要进行相应的账务处理。具体操作如下：
首先，借方应记入代理承销证券款科目，表示公司需要支付给代理承销证券款。这是因为公司需要支付给代理承销证券款作为佣金或报酬，所以代理承销证券款科目应该相应地减少。
其次，贷方应记入银行存款科目，表示公司的银行存款减少。这是因为公司需要支付给代理承销证券款，所以银行存款账户应该相应地减少。
需要注意的是，代理承销证券款科目期末余额一般在贷方，反映企业承销证券应付未付给委托单位的款项金额。这意味着公司在期末时尚未支付给代理承销证券款的金额会显示在该科目的贷方。
综上所述，当公司发行证券并收到代理承销证券款时，需要进行账务处理，包括借方记入银行存款科目和贷方记入代理承销证券款科目。而当公司需要将收到的代理承销证券款支付给对方时，需要进行相反的账务处理，即借方记入代理承销证券款科目和贷方记入银行存款科目。