专用基金是事业单位或企业按规定提取或设置的用于专门用途的资金。根据《事业单位财务规则》第六章“专用基金管理”的规定，专用基金包括修购基金、职工福利基金、医疗基金、科技成果转化基金和其他基金。
修购基金是单位按照事业收入和经营收入的一定比例提取，在修缮费和设备购置费中列支（各列50%），以及按照其他规定转入，用于固定资产维修和购置的资金。
职工福利基金是按照结余的一定比例提取以及按照其他规定提取转入，用于单位职工的集体福利设施、集体福利待遇的资金。
医疗基金是未纳入国家公费医疗经费开支范围的单位，按规定提取并参照公费医疗有关规定直接用于职工公费医疗开支的资金。
科技成果转化基金是单位按照事业收入的一定比例提取，在业务费中列支，以及在经营收支结余中提取转入，用于科技成果转化的资金。