在处理合作企业的利润分配和税务问题时，我们需要根据合伙人的身份类型来采取不同的计算和缴纳方式。
首先，如果合伙人是自然人，那么利润的分配将按照经营所得来计算。这意味着，我们需要将合伙人在合作企业中的所有收入和支出进行详细的记录和核算，以确定其应得的经营所得。然后，根据这一经营所得，我们可以计算出合伙人应该分得的利润部分。在确定了利润分配后，自然人合伙人需要按照所得税法的规定，对其经营所得进行汇算清缴，以确保其税款的正确缴纳。
其次，如果合伙人是法人或其他组织，那么利润的分配将依照企业所得税法律法规的规定进行。这通常涉及到对合作企业的总收入和总支出进行详细的核算，以确定其应得的企业所得税。然后，根据这一企业所得税，我们可以计算出合伙人应该分得的利润部分。在确定了利润分配后，法人或其他组织合伙人需要按照所得税法的规定，对其企业所得税进行汇算清缴，以确保其税款的正确缴纳。
在这两种情况下，合作企业的利润分配都是先分后税的原则。这意味着，我们需要先确定每个合伙人应得的利润部分，然后再根据其身份类型，分别按照经营所得或企业所得税法的规定，进行税款的计算和缴纳。这种先分后税的方式，可以确保每个合伙人的权益得到公平的保护，同时也符合税法的规定。
总的来说，无论是自然人还是法人或其他组织作为合伙人，我们都需要根据其身份类型，采取相应的利润分配和税款缴纳方式。这既可以保证合作企业的运营效率，也可以确保每个合伙人的权益得到公平的保护。