企业向银行申请开具银行本票，并将相应款项存入银行账户后，应妥善保管银行盖章退回的申请书存根联。根据这一重要凭证，企业需要编制付款凭证，以确保财务记录的准确性。具体来说，借记“其他货币资金—银行本票”科目，贷记“银行存款”科目。
当企业使用银行本票进行支付时，应根据发票、账单等相关凭证进行相应的会计分录。首先，企业应借记相关费用科目，如“材料采购”、“库存商品”等，以反映企业通过银行本票支付了相应的采购成本或库存商品的成本。同时，企业还应借记“应交税费—应交增值税（进项税额）”科目，以反映企业在购买商品或接受服务时所支付的增值税。
其次，企业应贷记“其他货币资金—银行本票”科目，以反映企业使用了银行本票进行支付。这一分录的目的是确保企业的银行本票余额得到正确记录，以便后续的账务核对和报表编制工作。
总之，企业在使用银行本票进行支付时，需要根据发票、账单等相关凭证进行相应的会计分录，包括借记相关费用科目和“应交税费—应交增值税（进项税额）”科目，以及贷记“其他货币资金—银行本票”科目。这些操作有助于企业准确记录财务信息，并确保账务核对和报表编制的准确性。