两家关联公司的相互往来入账，需要根据实际业务来确认对应的账务处理。总的原则是当做不相关的公司来处理。如果是购销业务，则一方做销售的账务处理，另一方做购进的账务处理。如果是往来款，则计入其他应收款、其他应付款进行核算。
在处理关联公司的往来入账时，首先需要考虑实际业务情况。如果涉及到购销业务，那么一方应该进行销售的账务处理，而另一方则应该进行购进的账务处理。这样可以确保双方的账务记录准确无误。
另外，如果涉及到往来款项，例如借款或贷款，这些款项应该计入其他应收款或其他应付款进行核算。这样可以清楚地反映出双方之间的资金往来情况，方便后续的账务核对和分析。
总之，处理关联公司的往来入账需要根据实际业务情况进行准确的账务处理。无论是购销业务还是往来款项，都需要按照相应的原则进行处理，以确保账务记录的准确性和可靠性。