行政单位工资的会计分录包括财政直接支付和财政授权支付两部分。
在财政直接支付方面，预算会计借记行政支出、事业支出等科目，贷记财政拨款预算收入。同时，财务会计借记应付职工薪酬，贷记财政拨款收入。年末时，根据本年度财政直接支付预算指标数与其实际支出数的差额，预算会计借记资金结存-财政应返还额度，贷记财政拨款预算收入；同时，财务会计借记财政应返还额度，贷记财政拨款收入。下年度恢复财政直接支付额度后，单位以财政直接支付方式发生实际支出时，预算会计借记行政支出、事业支出等，贷记资金结存-财政应返还额度；同时，财务会计借记应付职工薪酬，贷记财政应返还额度-财政直接支付。
财政授权支付业务方面，预算会计借记资金结存-零余额账户用款额度，贷记财政拨款预算收入；同时，财务会计借记零余额账户用款额度，贷记财政拨款收入。按规定支用额度时，按照实际支用的额度，预算会计借记行政支出、事业支出等，贷记资金结存-零余额账户用款额度；同时，财务会计借记库存物品、固定资产、应付职工薪酬、业务活动费用、单位管理费用等，贷记零余额账户用款额度。年末时，依据代理银行提供的对账单作注销额度的相关账务处理。预算会计借记资金结存-财政应返还额度，贷记资金结存-零余额账户用款额度；同时，财务会计借记财政应返还额度-财政授权支付，贷记零余额账户用款额度。下年年初恢复额度时，预算会计借记资金结存-零余额账户用款额度，贷记资金结存-财政应返还额度；同时，财务会计借记零余额账户用款额度，贷记财政应返还额度-财政授权支付。如果单位本年度财政授权支付预算指标数大于零余额账户用款额度下达数的，根据未下达的用款额度，预算会计借记资金结存-财政应返还额度，贷记财政拨款预算收入；同时，财务会计借记财政应返还额度-财政授权支付，贷记财政拨款收入。下年度收到财政部门批复的上年末未下达零余额账户用款额度时，预算会计借记资金结存-零余额账户用款额度，贷记资金结存-财政应返还额度；同时，财务会计借记零余额账户用款额度，贷记财政应返还额度-财政授权支付。