外商投资企业审批事项是指当事人就外商投资企业相关事项达成的补充协议对已获批准的合同“不构成重大或者实质性变更”的情况。根据最高人民法院的规定，在这种情况下，人民法院不应以未经外商投资企业审批机关批准为由认定该补充协议未生效。
具体来说，可以参考商务部外资司发布的《外商投资审批事项服务指南》。该指南规定了依法应由商务部审批的外商投资企业设立及变更（包括非独立法人分支机构的设立）的审批程序和要求。
首先，外商投资企业设立及变更的审批需要符合相关法律法规的规定。当事人在达成补充协议之前，应当了解并遵守这些法律法规的要求，确保补充协议的内容与已有合同相一致，不会对已获批准的合同产生重大或实质性变更。
其次，当事人在达成补充协议后，应当及时向外商投资企业审批机关提交相关申请材料。审批机关将根据法律法规的规定，对补充协议进行审查，并作出是否批准的决定。如果补充协议被批准，当事人可以按照批准的内容进行实施。
最后，当事人在实施补充协议的过程中，应当遵守外商投资企业审批机关的指导和监督。审批机关将对补充协议的实施情况进行监督，确保其符合法律法规的要求，并对不符合要求的情况采取相应的法律措施。
总之，外商投资企业审批事项涉及补充协议的生效问题，当事人应当遵守相关法律法规的规定，并向外商投资企业审批机关提交相关申请材料。审批机关将根据法律法规的规定，对补充协议进行审查，并作出是否批准的决定。当事人在实施补充协议的过程中，应当遵守审批机关的指导和监督，确保其符合法律法规的要求。