增值税普通发票和专用发票之间存在一些明显的区别。首先，增值税普通发票一般不能用于抵扣税款，而增值税专用发票则可以进行抵扣。这意味着，如果企业购买了货物或接受了服务并取得了增值税专用发票，他们可以将该发票上的税额从其应缴纳的增值税中扣除。
其次，增值税普通发票和专用发票在联次上也存在差异。一般来说，增值税专用发票有3联，包括存根联、发票联和记账联。而增值税普通发票则有2联或者更多，如五联发票。这种不同的联次设计有助于区分不同类型的发票，并方便企业和税务机关进行管理和核算。
第三，增值税专用发票通常是由一般纳税人或税务局代开的，而普通发票则可以由小规模纳税人和一般纳税人开具。这是因为增值税专用发票具有更高的抵扣功能，因此需要更加严格的管理和控制。而普通发票则相对灵活，适用于各种规模的纳税人。
总之，增值税普通发票和专用发票在抵扣能力、联次设计和开具主体等方面存在显著的差异。这些差异使得企业在选择发票类型时需要考虑其实际需求和纳税情况，以便更好地管理税务事务。