当企业更改扣税银行名称时，必须前往银行重新签订三方扣税协议。随后，需要将新的扣税协议的相应联次提交给税务机关录入系统，以便未来能够顺利进行税款的扣缴。

在处理从银行账户扣缴相应税款的账务时，应遵循以下步骤：

1. 确认扣税银行变更已完成并已签订新的三方扣税协议。

2. 将新协议的相关联次递交至税务机关进行系统录入。

3. 进行会计处理，具体操作如下：

借：应交税费—某某税款，

贷：银行存款。