企业可以通过访问自然人申报管理系统，使用公司账户登录后，进入查询统计界面。在这里，企业可以点击缴款记录查询，查看本单位实际交纳的个人所得税明细情况。一旦查询到对应期间的缴纳记录，企业可以继续点击完税凭证开具选项，从而下载扣缴凭证。此外，企业也可以选择前往银行打印对应的扣款单据。