对于一般纳税人来说，当收到高速公路过桥费的电子发票时，应按照发票上标明的金额乘以3%来计算可抵扣的进项税额。具体计算方法是：可抵扣的进项税额 = 过桥费金额 / 1.03 * 3%。

在处理这类费用时，一般纳税人单位的会计分录通常如下所示：

借方：管理费用（记录相关支出），

贷方：应交税费—应交增值税（进项税额）（反映可抵扣的税额），

以及贷方：银行存款等科目（表示支付方式）。