在处理代扣代征税款手续费的账务时，如果单位决定将此款项支付给申报人员，会计分录应为：

借记银行存款账户。

贷记其他应付款账户。

值得注意的是，在这种情况下，代扣代征税款手续费本身并不需要额外缴纳税款。

反之，如果单位不将该笔手续费支付给申报人员，则需按照相关税法规定计算并缴纳增值税。