新建厂房的投入使用本身并不涉及纳税。然而，一旦企业开始持有该房产，就需要缴纳房产税。房产税的税率为12%。如果房屋被出租，那么房产税将按照租金的1.2%来计算。此外，企业占用城市土地时，还需缴纳相应的土地使用税，而土地使用税的具体税率则需要由当地税务机关进行核定。