代付货款在增值税抵扣方面的影响是中性的。对于代付方而言，他们仅仅是先行支付了货款，而销售方会直接向实际购买方开具相应的发票。因此，货物的实际购买方可以依据这份发票进行增值税进项税额的抵扣。若销售方向代付方开具了发票，则由代付方负责抵扣增值税，并需要另外为实际购买方开具销项发票，以便后者能够完成进项税额的抵扣过程。