为了妥善管理公司寄件的快递费用，应遵循以下步骤来保存相关资料：

1、在寄送快递时，务必保留好快递存根（底单）。

2、前往快递官方网站或使用公众号小程序申请电子发票。

3、将获得的电子发票打印出来，并将其与底单一同粘贴。

4、在内部文件中详细记录快递费用及寄件详情。

若公司暂时无法提供发票，可以采取账务处理方式，但在进行汇算清缴时，需要对这部分费用进行调整增加，不允许将其作为税前扣除项。