在处理建筑分包工程的结算时，我们通常需要根据实际结算金额开具相应的发票给对方。具体到账务处理方面，当收到款项时，应进行如下操作：
1. 首先，确认收到的款项金额，并核对是否与合同或协议中的约定一致。 2. 根据确认后的金额，开具相应内容的发票给对方。 3. 在账务处理上，借记银行存款等科目，贷记主营业务收入以及应交税费—应交增值税（销项税额）。 4. 需要注意的是，所有操作都应在法律法规和公司政策允许的范围内进行。 5. 最后，确保所有的文件和记录都得到了妥善保存和归档，以备后续查询和使用。