当个人拥有两份工作，一份全职和一份兼职时，其个人所得税的计算方式需分别对待。全职工作的收入按照工资薪金所得进行个税计算；而兼职工作的收入则根据劳务报酬、稿酬所得或特许权使用费等不同类型分别计算。

在年度结束时，个人需要通过个人所得税APP完成汇算清缴工作，以确保所有收入来源的税务情况得到正确处理。