在处理旅客运输的进项抵扣时，企业无需进行进项发票的勾选认证。只需根据获取的各类票据（如火车票、飞机票及车票等）上的金额来计算可抵扣的税额，并在增值税申报过程中填写到相应的栏目中。

具体而言，旅客运输进项抵扣的账务处理流程如下：

首先，借记“管理费用”等相关科目以及“应交税费—应交增值税（进项税额）”；然后，贷记“银行存款”等相关科目。