若合同被判定为无效，已缴纳的税款需进行账务处理。具体操作如下：

1. 借记“应交税费—某某税款”科目。

2. 贷记“银行存款”科目。

对于因合同无效而需要退回已缴税款的情况，应向税务机关申请退还。相应的账务处理步骤如下：

1. 借记“银行存款”科目。

2. 贷记“应交税费—某某税款”科目。