查补的增值税，一般通过应交税费—应交增值税—税务检查调整科目进行核算。对于对应的滞纳金，则计入到营业外支出科目进行核算。经税务检查，额外需补缴的，其分录为：

借：以前年度损益调整，

贷：应交税费—应交增值税—税收检查调整。

实际缴纳增值税时，

借：应交税费—应交增值税—税收检查调整，

营业外支出—税收滞纳金，

贷：银行存款。