根据《国家税务总局关于印发的通知》（国税发〔2009〕79号）的规定，纳税人在纳税年度内预缴的企业所得税税款如果少于应缴的企业所得税税款，应在汇算清缴期内结清应补缴的税款。相反，如果预缴税款超过应纳税款，主管税务机关应及时按有关规定办理退税，或者经纳税人同意后抵缴其下一年度应缴的企业所得税税款。因此，纳税人应在年度汇算清缴时，办理退税。