专利申请费款项已支付，如果没有取得发票账务处理是，

借：预付账款，

贷：银行存款等科目。

今后取得发票的时候账务处理是，

借：无形资产—某某专利，

应交税费—应交增值税（进项税额），

贷：预付账款。