企业给职工发放的困难补助费属于职工福利费，一般通过应付职工薪酬科目核算。应付职工薪酬是企业根据有关规定应付给职工的各种薪酬，包括职工工资、奖金、津贴和补贴；职工福利费；医疗保险费、养老保险费、失业保险等。
计提员工困难补助时，会计分录为借：管理费用--职工福利费；贷：应付职工薪酬-职工福利费。实际支付时，会计分录为借：应付职工薪酬-职工福利费；贷：库存现金。