企业员工的个人所得税通常由企业代扣代缴，具体会计分录如下：

一、工资计提时：

借：管理费用/销售费用/开发成本等，

贷：应付职工薪酬。

二、发放时工资，代扣代缴个人所得税：

借：应付职工薪酬，

贷：应交税费—应交个人所得税（代扣工资个人所得税），

库存现金/银行存款（实发工资）。

三、缴纳个人所得税时：

借：应交税费—应交个人所得税（代扣工资个人所得税），

贷：银行存款。