企业发生软件服务费时，应根据费用金额的大小选择适当的核算科目。如果费用金额较大且有对应的发票，应通过“无形资产”科目进行核算。具体操作如下：借记“无形资产”，应交税费—应交增值税（进项税额），贷记“银行存款”（或应付账款科目）。
另一方面，如果公司支付的软件服务费用金额较小，同样需要取得对应的发票。在这种情况下，应将相关费用计入“管理费用”的二级科目“软件服务费”。具体操作如下：借记“管理费用—软件服务费”，应交税费—应交增值税（进项税额），贷记“银行存款”。
总之，企业在处理软件服务费时，应根据费用金额的大小选择合适的核算科目，并确保有对应的发票作为依据。这样可以确保财务记录的准确性和合规性。