所得税减免部分的会计分录有两种操作方式。一种是直接按减免后实际应纳税额进行计提和支付，不用做减免的部分的分录。另外一种是按减免之前的金额进行计提，然后在支付的时候将减免的部分计入到营业外收入—税收减免科目。
分录为：借：所得税费用；贷：应交税费—应交企业所得税。实际缴纳的时候，借：应交税费—应交企业所得税；贷：银行存款；营业外收入—税收减免。