当单位支付投标保证金时，账务处理如下：
首先，支付的投标保证金会通过其他应收款科目进行核算。这意味着在账务系统中，这笔资金被视为一项应收款项，而非现金或其他流动资产。这样做的目的是为了更好地追踪和管理投标保证金的使用情况。
其次，支付投标保证金会导致货币资金减少。货币资金是指单位所拥有的现金、银行存款和其他流动资产的总和。由于投标保证金被用于支付，因此这部分资金将从单位的货币资金中扣除。
最后，资产减少计入贷方核算。在会计中，资产的增加通常计入借方，而资产的减少则计入贷方。这是因为资产的减少意味着单位拥有的资产减少了，因此需要在贷方账户中记录这一变化。
综上所述，单位支付投标保证金时的账务处理是：借：其他应收款—投标保证金；贷：银行存款等科目。这样的账务处理方式有助于单位更好地管理和追踪投标保证金的使用情况，同时也符合会计原则和规范。