当支付宝账户的款项转入到公司的基本账户上时，一般需要对这笔款项进行核算。首先，对于支付宝的款项，会计上会将其计入到其他货币资金—支付宝账户中。这是因为支付宝账户中的款项属于公司的其他货币资金，需要进行专门的核算。
如果在这个过程中产生了对应的手续费，那么这笔手续费会计上会计入到财务费用中。财务费用是指企业在经营活动中所发生的与财务管理相关的费用，包括利息支出、手续费等。因此，对于支付宝账户转入款项所产生的手续费，应该计入到财务费用中进行核算。
根据上述情况，对应的会计分录为：借记银行存款，贷记其他货币资金—支付宝款项。这个分录表示了将支付宝账户的款项转入到公司基本账户上的过程，同时也反映了其他货币资金的增加和其他货币资金—支付宝款项的减少。
综上所述，支付宝账户的款项转入到公司基本账户上的核算过程主要包括将款项计入到其他货币资金—支付宝账户中，并将产生的手续费计入到财务费用中。同时，对应的会计分录为借记银行存款，贷记其他货币资金—支付宝款项。这些步骤和分录的正确处理能够确保企业对支付宝账户的款项进行准确的核算和管理。