当企业选择出包工程方式自行建造固定资产时，在建设过程中发生的所有费用均应计入“在建工程”科目进行核算。具体操作如下：首先，企业在支付相关费用时，需借记“在建工程”科目，贷记“银行存款”科目；其次，当收到承包单位提供的账单并补付工程价款时，同样需要借记“在建工程”科目，贷记“银行存款”科目；最后，在结算建设期间的资本化借款利息时，借记“在建工程”科目，贷记“长期借款”科目。

待工程完工并通过验收合格交付使用时，企业应根据实际发生的全部支出，借记“固定资产”科目，贷记“在建工程”科目。这一过程确保了企业能够准确地反映其固定资产的价值和成本。