收到差额征收的发票，应该按照发票上的金额和税额入账。因为差额征税，应该按照发票上的金额和税额支付，只是发票税额是按照差额计算。企业接受应税服务时，按规定允许扣减销售额而减少的销项税额，借记“应交税费—应交增值税(营改增抵减的销项税额)”科目，按实际支付或应付的金额与上述增值税额的差额，借记“主营业务成本”等科目，按实际支付或应付的金额，贷记“银行存款”、"应付账款”等科目。