根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（国务院令2007年第512号）第九条规定，企业应纳税所得额的计算，以权责发生制为原则。这意味着属于当期的收入和费用，无论款项是否收付，都应作为当期的收入和费用；反之，不属于当期的收入和费用，即使款项已经在当期收付，也不应计入当期的收入和费用。当然，本条例和国务院财政、税务主管部门另有规定的除外。
在实际操作中，企业经常会遇到跨期费用的处理问题。通常情况下，对于跨月不跨年的费用，财税部门的监管相对较为宽松。然而，对于跨年费用，往往口径较为严格。因此，企业在进行汇算清缴时，应该对跨年费用进行适当调整，以确保其符合权责发生制原则。
具体而言，企业在处理跨期费用时，可以采取以下措施：首先，对于已经发生的费用，无论款项是否收付，都应按照权责发生制原则计入当期的费用。其次，对于尚未发生的费用，即使款项已经在当期收付，也不应计入当期的费用。最后，对于跨年费用，企业应根据具体情况进行调整，确保其符合权责发生制原则。
总之，企业在处理跨期费用时，应当遵循权责发生制原则，并根据具体情况进行适当调整。这样不仅有助于企业准确计算应纳税所得额，还能够避免因违反税收法规而导致的不必要的风险。